擁有過目不忘能力的少年醫聖柯齊眉，因厭煩交際失蹤三年，在“閱微草堂”藥店打雜，獨對店主晏沁潔的《青囊遺冊》感興趣，卻被秦草視作情敵，展露中醫知識後又遭秦師傅敵視。他先治好上吊婦女，應晏沁潔之邀參加中醫集會一鳴驚人。會上西醫屢屢羞辱中醫，柯齊眉自曝身份使其鎩羽而歸。恰逢杭城首富女兒病重，西醫束手無策，柯齊眉略施小計治癒患者，西醫狼狽認輸。最終他獲得《青囊遺冊》，繼續發揚中醫、攻克絕症。
